Shinichi Kudo adalah siswa kelas 2 SMA yang tertarik mengenai dunia misteri. Di sela-sela kesibukan sekolahnya, ia sering membantu polisi menyelesaikan berbagai kasus kejahatan dan pembunuhan. Suatu hari, selama penyelidikan, ia disergap dan dilumpuhkan oleh anggota sindikat kejahatan yang dikenal sebagai Organisasi Hitam. Ia pun dipaksa meminum obat percobaan yang berbahaya oleh kelompok baju …